北京门市房办理营业执照问题1

我从二房东手上租了一间商铺，但是办理不了营业执照，原因是这个房屋是老房改造，有住建委出资修建并改造成门脸房，有房东和住建委签署的协议，但是现在工商局办理不了营业执照，可是隔壁一家在2010年的时候就办理了营业执照。我和房东之间有条协议是，由于营业执照问题，产生的一切损失由他全部负责，现在我的店铺工商局不让营业，我房租，装修和货品等成本投入共计14W，请问房东能赔偿吗？或者说怎样可以办理营业执照？谢谢