没填违约金的协议能要求违约金吗

我是今年毕业的，我跟一家集团公司签了一份就业协议书，是一份三方协议，另一方是学校。去了他单位几天就申请了辞职，然而那单位的联系人说要办妥那个离职手续要交那2000元的违约金，这个违约金的说法在协议上并没有填，在面试，入职，离职申请的时候都没有提过，可以说是我完全不知情的。他说那个违约金他们是一直这样收的，他这样收取违约金合法吗，有哪一条法律法规是支持他这样做的，或是可以给我根据来维权的。我这样的情况能不能去申请劳动仲栽呢，求各位法律人士帮帮我。