协议书和产权证下，哪个更有效？房屋产权应归谁所有？

家有一套4间房屋的老房，86年由父亲出资翻建新房。87年经奶奶同意将产权写在我父母的名下。后91年奶奶写说明书一份，内容大体为房屋由我父母建造和使用，并归我父母所有。当时说明书也未提及有我大伯所谓的2间房屋。（奶奶于96年底已逝）现房屋已经拆迁，我大伯提起诉讼想平分房屋财产。大伯在法庭上出示了一份自拟的有关当时重建房屋的协议书，此协议书并没有我父亲签名，父亲也没有认可。协议书上还提及到东面2间由我大伯购买别人的，并没有出示当时的买卖协议原件，只有一份卖方临时的证明（文字内容和签名都是打印的，只有手印和身份证复印件一份）。最终法院判定协议书内容有效。我父母拥有房产证和土地使用证，不能说明此房归我父母所有么？